ББИ на сегодняшний день — одно из ведущих учебных заведений в России в области академического богословия, современной библеистики, истории Церкви, христианской культуры и философии религии. Образовательная концепция института предполагает совмещение богословского и светского подходов к подготовке современного специалиста-теолога. ББИ имеет лицензию дополнительного профессионального образования: реализует образовательные программы по повышению квалификации по направлению «Теология», производит переквалификацию специалистов. Важнейшим направлением деятельности института является издательская деятельность, направленная в основном на выпуск научных трудов, учебников, хрестоматий, библейских комментариев и словарей.